Sus objetivos son:
 Implementar un Sistema de Información en Salud que permita ofrecer conocimiento acerca de los problemas de salud para la mejora de políticas, programas y servicios sanitarios.
 Consolidar un espacio de discusión sobre temas de salud pública.
 Brindar apoyo técnico (teórico y metodológico) para el desarrollo de investigaciones.
 Propiciar el intercambio de experiencias y capacidades entre gobierno, instituciones y sectores de la nación y región.
 Apoyar la aplicación de tecnologías de la información en el sector de la salud.
 Participar en redes de trabajo junto a otros observatorios.